SD Muhammadiyah 1 Krian didirikan oleh Pimpinan Cabang Muhammadiyah Krian pada tahun 1999 tempatnya terletak diwilayah kelurahan / desa  Katerungan.Sejak awal  berdiri, SD  Muhammadiyah   1 Krian    sudah berkeinginan  dan bercita -cita  sebagai salah satu sekolah unggulan yang diperhitungkan minimal di wilayah sekitarnya.

Pada awal berdiri sekitar awal tahun 1999, SD Muhammadiyah 1 Krian dengan susah payah mencari siswa secara aktif dan alhamdulillah akhirnya hanya mempunyai 4 siswa / peserta didik, itupun putra / putri dari saudara atau tetangga rumah. Tapi dengan semangat perjuangan tanpa lelah dari bapak/Ibu guru alhamdulillah dari tahun ke tahun menunjukkan progresifitas secara signifikan.

Sejak berdiri pada tahun 1999 SD Muhammadiyah 1 Krian baru sekali mengikuti akreditasi, dan alhamdulillah hasilnya cukup membanggakan walaupun masih banyaknya kekurangan-kekurangan tetapi dapat menunjukkan hasil positif dengan nilai terakreditasi “A” Dan  alhamdulillah tahun ini SD Muhammadiyah menjadi salah satu Sekolah Unggulan di tingkat provinsi. Hal ini tidak lepas dari do’a dan kerja keras yang dilakukan oleh para pendidik, wali murid dan support dari Bapak-bapak Pimpinan Cabang Muhammadiyah Krian serta semua pihak yang ingin melihat SD Muhammadiyah 1 Krian  lebih maju.

SD Muhammadiyah 1 Krian mencoba untuk selalu membuat inovasi-inovasi baru, seperti metode pembelajaran, pengembangan kurikulum, manajemen sekolah, keterlibatan wali siswa (paguyuban kelas) serta kegiatan-kegiatan yang bersifat sosial ataupun lainnya dengan harapan dapat meningkatkan kualitas SD Muhammadiyah 1 Krian.

Didorong rasa ingin menjadikan sekolah berstandar nasional bahkan internasional, SD Muhammadiyah 1 Krian sudah mempunyai beberapa program-program seperti : english and arabic day, studi banding baik dalam maupun luar negeri, pelatihan guru, outbound training dan lain-lain.